He bisogna che disegni della roba adatta ad essere stampata, cioe' ottimizzata per un CAM da FDM.
L'unica opera (vecchia) specifica per la ottimizzazione della progettazione per CAM -> FDM che mi viene in mente: Clifford Smyth - Functional Design for 3d Printing - Designing Printed Things for Everyday Use (2017, Clifford Smyth).
Comunque l'approccio e' quello che usi tu: io disegno sul mio CAD considerando perimetri, altezza layer e overhangs che posso ottenere in stampa, genero un STL, lo guardo nel mio CAM (lo slicer), ottimizzo entrambi e poi stampo un prototipo. Poi guardando gli ingombri del prototipo risolvo i problemi e stampo le versioni buone.
Ma le tolleranze te le devi sgroppare te: devi vedere cosa puo' fare la tua stampante e poi ottimizzare lo sclicer se ha delle compensazioni e poi disegnare impostando il tipo di tolleranze (es snap o tight fit, 0.15 - 0.4mm).