Potrebbe essere che la direzione dell'asse X sia invertita: invece che andare a dx va a sx, puoi modificare la relativa voce nel file di configurazione e ricompilarlo oppure, se e' quello, invertire l'ordine dei cavi nel connettore di quel motore.
Metti l'estrusore al centro, accendi la stampante e senza fare l'home prova a muovere l'hotend dalla console: le direzioni sono giuste?